甲醇对人体的毒性作用较大，4 g～10 g即可引起严重中毒。甲醇在体内的代谢产物是甲酸和甲醛，其毒性更大于甲醇，所以极少量的甲醇也能引起慢性中毒。在酿酒过程中，果胶在酶或高温的作用下脱甲酯变为果胶酸与甲醇。如果选用果胶质含量较高的原料，如过熟或腐败的水果、薯类以及野生植物等，酒中甲醇含量会高。用黑曲作糖化剂时，由于黑曲霉所含果胶酶较多，成品酒中甲醇含量也会高。
GB 2757-1981《蒸馏酒及配制酒卫生标准》中规定以谷类为原料者甲醇含量≤0. 04 g／100 mL，以薯干及代用品为原料者甲醇含量≤0.12 g／100 mL。
GB 15037-2006《葡萄酒》中规定白、桃红葡萄酒中甲醇含量≤250 mg/L，红葡萄酒中甲醇含量≤400 mg/L。
虽然甲醇具有较大毒性，但严格按照我国饮料酒标准生产并按相关卫生标准检验合格的饮料酒中甲醇含量很少，在适度饮用饮料酒的情况下是不会对人体产生不良影响的。
